期刊简介
中华医学会主办。本刊是外科学类核心期刊，国家科学技术部中国科技论文统计源期刊，中国生物医学核心期刊，中华医学会外科学分会两本会刊之一，以“探讨理论，更新知识，指导科研，服务临床”为办刊宗旨，其内容包括外科各个专业，是紧密结合临床实践的全国实验外科专业刊物。设有“论坛”、“述评”、“实验研究”、“临床研究”、“新技术与新方法”、“动物模型”、“简报”、“综述”等栏目。创刊28年来，本刊立足外科前沿，评论医学资讯，报道实验外科最新科技成果，内容新颖，信息量大，杂志被引频次与影响因子逐年增加，已成为我国中高级外科医师学术交流的重要园地。
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首页>中华实验外科杂志
- 杂志名称：中华实验外科杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1001-9030
- 国内刊号：42-1213/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)
炎性因子相关椎间盘退变基因表达谱芯片的生物信息学研究
尚凯；王德国；王成
关键词：椎间盘退变, 炎性因子, 基因表达谱, 生物信息学
摘要：目的 研究炎性因子相关退变椎间盘基因表达谱芯片数据,应用生物信息学方法挖掘炎性因子作用后退变椎间盘的关键差异表达基因,探讨其相关信号通路及相互作用网络.方法 选择同一芯片平台的两组椎间盘退变患者的基因表达谱数据集:GSE41883[肿瘤坏死因子-α(TNF-α)作用于退变椎间盘细胞]和GSE27494[白细胞介素-1β(IL-1β)作用于退变椎间盘细胞],采用R语言分别筛选两组数据集中的差异表达基因,经Excel软件交集,选择两组数据集中共有的差异表达基因,利用DAVID、STRING软件对其进行初步功能聚类、信号通路及相互作用关系分析.结果 TNF-α、IL-1β分别作用于退变椎间盘细胞后共同发生变化的差异表达基因255条,其中上调141条,下调114条;基因本体注释分析表明这些差异表达基因主要与细胞因子活性、生长因子活性、炎性反应、损伤后反应等相关;信号通路分析表明这些差异表达基因主要涉及到细胞因子相互作用、凋亡、NOD样受体等信号通路相关;相互作用网络分析表明前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)、细胞间黏附分子1(ICAM1)、肾母细胞瘤过度表达基因(NOV)等基因可能在椎间盘退变中起关键作用.结论 应用生物信息学方法分析炎性因子作用后退变椎间盘基因表达谱发现,ICAM1等基因可能通过炎性反应在椎间盘退变的发生发展中起一定作用,生物信息学方法可发现一些潜在靶基因.
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