期刊简介
中华医学会主办。本刊是外科学类核心期刊，国家科学技术部中国科技论文统计源期刊，中国生物医学核心期刊，中华医学会外科学分会两本会刊之一，以“探讨理论，更新知识，指导科研，服务临床”为办刊宗旨，其内容包括外科各个专业，是紧密结合临床实践的全国实验外科专业刊物。设有“论坛”、“述评”、“实验研究”、“临床研究”、“新技术与新方法”、“动物模型”、“简报”、“综述”等栏目。创刊28年来，本刊立足外科前沿，评论医学资讯，报道实验外科最新科技成果，内容新颖，信息量大，杂志被引频次与影响因子逐年增加，已成为我国中高级外科医师学术交流的重要园地。
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首页>中华实验外科杂志
- 杂志名称：中华实验外科杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1001-9030
- 国内刊号：42-1213/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)
生物信息学模型在丙型病毒性肝炎肝硬化肝癌中的应用
汪炳瑞；刘卓然；杨卫平；沈柏用；彭承宏；邱伟华
关键词：生物信息学, 数据库, 基因组学, 网络, 蛋白质组学, 肝癌
摘要：目的 利用生物信息学技术,分析和处理相关高通量数据,查找或建立丙型病毒性肝炎导致肝癌发生相关的基因、蛋白质调控网络以及pathway功能注释信息,建立肝癌蛋白质网络,从而阐释丙型病毒性肝炎相关性肝癌动态发展机制.方法 通过文本挖掘技术对数据收集及整理,利用倍数变化(FC)方法对GEO数据库中肝癌相关3组基因表达谱芯片进行分析,计算差异表达基因,得到和肝癌相关的数据信息.从GEO数据库中获取两组基因表达谱芯片,利用FC方法得到肝癌阶段的异常表达基因集,再将得到的基因集投射到蛋白质相互作用关系,以得到相应的蛋白质网络.结果 GEO数据库中收集到19张正常组芯片、29张丙型病毒性肝炎肝硬化芯片和16张丙型病毒性肝炎肝硬化伴肝癌芯片,利用FC方法得到肝硬化阶段差异基因1 404个,肝癌阶段1 129个.对基因集进行了GO、Pathway功能注释富集分析以说明其内在含义并验证疾病相关基因收集的结果.利用收集的数据建立了肝癌发生发展过程中的蛋白质相互作用动态网络.结论 利用文本挖掘及生物信息学技术收集了肝癌相关基因和蛋白数据,并建立了肝癌发展过程中的动态蛋白质网络.
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