期刊简介
中华医学会主办。本刊是外科学类核心期刊，国家科学技术部中国科技论文统计源期刊，中国生物医学核心期刊，中华医学会外科学分会两本会刊之一，以“探讨理论，更新知识，指导科研，服务临床”为办刊宗旨，其内容包括外科各个专业，是紧密结合临床实践的全国实验外科专业刊物。设有“论坛”、“述评”、“实验研究”、“临床研究”、“新技术与新方法”、“动物模型”、“简报”、“综述”等栏目。创刊28年来，本刊立足外科前沿，评论医学资讯，报道实验外科最新科技成果，内容新颖，信息量大，杂志被引频次与影响因子逐年增加，已成为我国中高级外科医师学术交流的重要园地。
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首页>中华实验外科杂志
- 杂志名称：中华实验外科杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1001-9030
- 国内刊号：42-1213/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：CA 化学文摘(美), 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊)
胰腺癌增生分化及凋亡相关蛋白互作动态网络特征分析
林大伟；马丁；杨卫平；沈柏用；彭承宏；邱伟华
关键词：基因芯片, 蛋白质网络, 胰腺癌
摘要：目的 利用生物信息学技术查找与建立胰腺癌相关基因、单核苷酸多态性(SNP)、微小RNA(miRNA)、蛋白质调控网络以及蛋白通路(pathway)功能注释等信息数据,并建立胰腺癌增生分化及凋亡相关蛋白互作动态网络.方法 通过文本挖掘技术和已有胰腺癌数据库(PC-GDB、Ensembl)进行数据收集和整理,然后利用倍数变化(FC)方法对高通量基因表达数据库(GEO)中胰腺癌相关基因表达谱芯片进行分析,计算正常组和疾病组的差异表达基因,得到和胰腺癌相关的数据信息.进一步将GEO数据库中获取的3组基因表达谱芯片(编号:GSE22780、GSE22973、GSE14245)筛选后,将基因芯片分为2组(正常组、胰腺癌组),利用FC方法得到胰腺癌的异常表达基因集,再将得到的基因集投射到蛋白质相互作用关系,得到相应的蛋白质网络,并取其中相对独立、相互作用较为集中且与增生分化及凋亡密切相关的子网络进行功能注释富集分析.结果 GEO数据库中得到差异基因有1 766个,PC-GDB和Ensembl数据库中潜在与胰腺癌相关基因1 173个,胰腺癌相关miRNA共140个,疾病相关SNPs共501个.建立了胰腺癌发生发展过程中的蛋白质相互作用动态网络,并分析其中主要发挥调节增生、诱导分化及凋亡作用的子网络.结论 利用文本挖掘及生物信息学技术收集了胰腺癌相关基因和蛋白数据,并建立了胰腺癌增生分化及凋亡相关蛋白互作动态网络,该网络可为后续针对胰腺癌的研究提供线索和支持,尤其可用于寻找胰腺癌的诊治靶点.
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